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在Ubuntu 18.04上安装R的方法

article 2024/11/13 17:53:14

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简介

R 是一种专门用于统计计算和图形的开源编程语言。由 R Foundation for Statistical Computing 支持，它被广泛用于开发统计软件和进行数据分析。R 是一种越来越受欢迎且可扩展的语言，拥有活跃的社区，提供了许多用户生成的针对特定研究领域的软件包，使其适用于许多领域。

在本教程中，我们将安装 R，并展示如何从官方 Comprehensive R Archive Network (CRAN) 添加软件包。

先决条件

要按照本教程进行操作，您需要具有以下配置的 Ubuntu 18.04 服务器：

至少 1GB 的 RAM
具有 sudo 权限的非根用户

要了解如何实现这种设置，请按照我们的手动初始化服务器设置指南或运行我们的自动化脚本。

一旦满足这些先决条件，您就可以开始了。

步骤 1 — 安装 R

由于 R 是一个快速发展的项目，最新的稳定版本并不总是可以从 Ubuntu 的软件仓库中获取，因此我们将首先添加由 CRAN 维护的外部仓库。

首先，让我们添加相关的 GPG 密钥。

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9

当我们运行该命令时，将会收到以下输出：

执行: /tmp/apt-key-gpghome.4BZzh1TALq/gpg.1.sh --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
gpg: key 51716619E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported
gpg: Total number processed: 1
gpg:               imported: 1

一旦我们获得了可信任的密钥，我们就可以添加仓库了。

请注意，如果您不使用 18.04 版本，您可以从 R 项目 Ubuntu 列表中找到相应的仓库，每个版本都有一个命名。Ubuntu 18.04 的名称是 Bionic Beaver，而 R 的最新版本是 4.0，因此命名约定为 ubuntu bionic-cran40。

sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/'

在显示的输出中，您应该识别出类似以下的行：

...
Get:4 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ InRelease [3626 B]                          
...                    
Get:22 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ Packages [20.4 kB]
...

现在，我们需要在此之后运行 update 命令，以便从新仓库中包含软件包清单。

sudo apt update

输出中应该包含类似以下的行：

...
Hit:1 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ InRelease
...

如果上述行出现在 update 命令的输出中，我们已成功添加了仓库。我们可以确保不会意外安装旧版本。

此时，我们已准备好使用以下命令安装 R。

sudo apt install r-base

如果提示确认安装，请按 y 继续。

截至撰写本文时，CRAN 的最新稳定版本是 4.0.1，在启动 R 时会显示。

由于我们计划为系统上的每个用户安装一个示例软件包，因此我们将以 root 用户身份启动 R，这样库将自动对所有用户可用。或者，如果您在没有 sudo 的情况下运行 R 命令，可以为您的用户设置一个个人库。

sudo -i R

R version 4.0.0 (2020-04-24) -- "Arbor Day"
Copyright (C) 2020 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
...
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.

>

这证实我们已成功安装了 R 并进入了其交互式 shell。

步骤 2 — 从 CRAN 安装 R 软件包

R 的强大之处之一在于其丰富的附加软件包。为了演示目的，我们将安装 txtplot，一个输出包括散点图、折线图、密度图、acf 和条形图的 ASCII 图形的库：

install.packages('txtplot')

安装完成后，我们可以加载 txtplot：

library('txtplot')

如果没有错误消息，说明库已成功加载。现在让我们使用一个示例来演示其基本绘图功能，该示例演示了一个包含汽车速度和根据 1920 年代的数据计算的停车距离的示例数据，该数据由 R 的 datasets 软件包提供：

txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = 'speed', ylab = 'distance')

      +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
  120 +                                                   *    +
      |                                                        |
d 100 +                                                   *    +
i     |                                    *                *  |
s  80 +                          *         *                   +
t     |                                       * *    *    *    |
a  60 +                          *  *      *    *      *       +
n     |                        *         * *  * *              |
c  40 +                *       * *    *  *    * *              +
e     |         *      *  * *  * *  *                          |
   20 +           *    *  * *       *                          +
      |  *      *    *                                         |
    0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
           5          10           15          20          25   
                                speed

如果您有兴趣了解更多关于 txtplot 的信息，请在 R 解释器中使用 help(txtplot)。

可以使用 install.packages() 从 CRAN 安装任何预编译软件包。要了解更多可用内容，您可以在 Available CRAN Packages By Name 列表中按名称查找官方软件包的列表。

要退出 R，您可以输入 q()。除非您想保存工作区图像，否则在提示时按 n。