基于YOLOv8深度学习的医学影像甲状腺结节病症检测诊断研究与实现(PyQt5界面+数据集+训练代码)
随着生活方式的改变和医疗技术的进步,甲状腺结节的发病率在全球范围内逐年上升,成为一种常见的内分泌系统疾病。尽管大多数甲状腺结节为良性,但其中部分结节可能发展为恶性,进而演变为甲状腺癌。因此,如何在早期对甲状腺结节进行准确的检测与分类,成为临床诊断中的一项关键任务。传统的甲状腺结节诊断依赖于超声成像和病理活检,但这种方法不仅依赖医生的经验,还可能导致误诊或漏诊,给病人带来不必要的心理压力和身体负担。
本文提出了一种基于YOLOv8深度学习算法的医学影像甲状腺结节检测与诊断系统,旨在解决传统方法的局限性。YOLOv8模型以其优异的实时目标检测性能和高精度著称,能够快速处理大规模医学影像数据,自动识别并分类甲状腺影像中的结节。我们构建的系统能够将甲状腺结节分为恶性和良性两类,极大地提升了诊断效率。为增强用户体验,系统采用PyQt5框架设计了可视化用户界面,医生可以通过该界面直观查看检测结果,并与系统进行交互,例如调整参数、保存数据或导出报告。
系统所使用的数据集涵盖了不同类型和形态的甲状腺结节影像,确保了模型的广泛适应性和泛化能力。在模型训练过程中,我们通过数据增强、迁移学习等技术,进一步提高了模型在复杂病例中的表现。实验结果表明,该系统不仅在恶性和良性结节的分类上达到了较高的准确率,还在处理速度和鲁棒性方面表现出色。与传统诊断方法相比,基于YOLOv8的甲状腺结节检测系统为临床提供了有效的辅助诊断工具,具有广泛的应用前景,尤其是在大规模筛查和远程医疗等场景中。
本研究为甲状腺结节的早期筛查和临床诊断提供了一种高效、可靠的解决方案,有望减少患者的心理负担,并为医生提供更有力的决策支持,从而提高整体诊疗质量。
算法流程
项目数据
通过搜集关于数据集为各种各样的阿尔兹海默症相关图像,并使用Labelimg标注工具对每张图片进行标注,分2个检测类别,分别是’良性结节’,’恶性结节’。
目标检测标注工具
(1)labelimg:开源的图像标注工具,标签可用于分类和目标检测,它是用python写的,并使用Qt作为其图形界面,简单好用(虽然是英文版的)。其注释以 PASCAL VOC格式保存为XML文件,这是ImageNet使用的格式。此外,它还支持 COCO数据集格式。
(2)安装labelimg 在cmd输入以下命令 pip install labelimg -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
结束后,在cmd中输入labelimg
初识labelimg
打开后,我们自己设置一下
在View中勾选Auto Save mode
接下来我们打开需要标注的图片文件夹
并设置标注文件保存的目录(上图中的Change Save Dir)
接下来就开始标注,画框,标记目标的label,然后d切换到下一张继续标注,不断重复重复。
Labelimg的快捷键
(3)数据准备
这里建议新建一个名为data的文件夹(这个是约定俗成,不这么做也行),里面创建一个名为images的文件夹存放我们需要打标签的图片文件;再创建一个名为labels存放标注的标签文件;最后创建一个名为 classes.txt 的txt文件来存放所要标注的类别名称。
data的目录结构如下:
│─img_data
│─images 存放需要打标签的图片文件
│─labels 存放标注的标签文件
└ classes.txt 定义自己要标注的所有类别(这个文件可有可无,但是在我们定义类别比较多的时候,最好有这个创建一个这样的txt文件来存放类别)
首先在images这个文件夹放置待标注的图片。
生成文件如下:
“classes.txt”定义了你的 YOLO 标签所引用的类名列表。
(4)YOLO模式创建标签的样式
存放标签信息的文件的文件名为与图片名相同,内容由N行5列数据组成。
每一行代表标注的一个目标,通常包括五个数据,从左到右依次为:类别id、x_center、y_center、width、height。
其中:
–x类别id代表标注目标的类别;
–x_center和y_center代表标注框的相对中心坐标;
–xwidth和height代表标注框的相对宽和高。
注意:这里的中心点坐标、宽和高都是相对数据!!!
存放标签类别的文件的文件名为classes.txt (固定不变),用于存放创建的标签类别。
完成后可进行后续的yolo训练方面的操作。
模型训练
模型的训练、评估与推理
1.YOLOv8的基本原理
YOLOv8是一个SOTA模型,它建立在Yolo系列历史版本的基础上,并引入了新的功能和改进点,以进一步提升性能和灵活性,使其成为实现目标检测、图像分割、姿态估计等任务的最佳选择。其具体创新点包括一个新的骨干网络、一个新的Ancher-Free检测头和一个新的损失函数,可在CPU到GPU的多种硬件平台上运行。
YOLOv8是Yolo系列模型的最新王者,各种指标全面超越现有对象检测与实例分割模型,借鉴了Yolov5、Yolov6、YoloX等模型的设计优点,在全面提升改进Yolov5模型结构的基础上实现,同时保持了Yolov5工程化简洁易用的优势。
Yolov8模型网络结构图如下图所示:
2.数据集准备与训练
本研究使用了包含各种甲状腺结节病症相关图像的数据集,并通过Labelimg标注工具对每张图像中的目标边框(Bounding Box)及其类别进行标注。然后主要基于YOLOv8n这种模型进行模型的训练,训练完成后对模型在验证集上的表现进行全面的性能评估及对比分析。模型训练和评估流程基本一致,包括:数据集准备、模型训练、模型评估。本次标注的目标类别为甲状腺结节病症,数据集中共计包含1863张图像,其中训练集占1452张,验证集占411张。部分图像如下图所示:
部分标注如下图所示:
图片数据的存放格式如下,在项目目录中新建datasets目录,同时将检测的图片分为训练集与验证集放入datasets目录下。
接着需要新建一个data.yaml文件,用于存储训练数据的路径及模型需要进行检测的类别。YOLOv8在进行模型训练时,会读取该文件的信息,用于进行模型的训练与验证。
data.yaml的具体内容如下:
train: E:/ThyroidNoduleDetection_v8/datasets/train/images 训练集的路径
val: E:/ThyroidNoduleDetection_v8/datasets/val/images 验证集的路径
# test: E:/ThyroidNoduleDetection_v8/datasets/test/images 测试集的路径
nc: 2 模型检测的类别数,共有2个类别。
names: [‘benign’, ‘malignant’]
这个文件定义了用于模型训练和验证的数据集路径,以及模型将要检测的目标类别。
数据准备完成后,通过调用train.py文件进行模型训练,epochs参数用于调整训练的轮数,batch参数用于调整训练的批次大小(根据内存大小调整,最小为1)。
CPU/GPU训练代码如下:
加载名为 yolov8n.pt 的预训练YOLOv8模型,yolov8n.pt是预先训练好的模型文件。
使用YOLO模型进行训练,主要参数说明如下:
(1)data=data_yaml_path: 指定了用于训练的数据集配置文件。
(2)epochs=150: 设定训练的轮数为150轮。
(3)batch=4: 指定了每个批次的样本数量为4。
(4)optimizer=’SGD’):SGD 优化器。
(7)name=’train_v8′: 指定了此次训练的命名标签,用于区分不同的训练实验。
3.训练结果评估
在深度学习的过程中,我们通常通过观察损失函数下降的曲线来了解模型的训练情况。对于YOLOv8模型的训练,主要涉及三类损失:定位损失(box_loss)、分类损失(cls_loss)以及动态特征损失(dfl_loss)。训练完成后,相关的训练过程和结果文件会保存在 runs/ 目录下,具体如下:
各损失函数作用说明:
定位损失box_loss:预测框与标定框之间的误差(GIoU),越小定位得越准;
分类损失cls_loss:计算锚框与对应的标定分类是否正确,越小分类得越准;
动态特征损失(dfl_loss):DFLLoss是一种用于回归预测框与目标框之间距离的损失函数。在计算损失时,目标框需要缩放到特征图尺度,即除以相应的stride,并与预测的边界框计算Ciou Loss,同时与预测的anchors中心点到各边的距离计算回归DFLLoss。这个过程是YOLOv8训练流程中的一部分,通过计算DFLLoss可以更准确地调整预测框的位置,提高目标检测的准确性。
训练结果如下:
这张图展示了YOLOv8模型在训练和验证过程中的多个重要指标的变化趋势,具体如下:
train/box_loss:
(1)这是训练过程中边界框损失的变化。边界框损失用于衡量模型预测的目标框与实际目标框的差异。
(2)图中可以看到,随着训练的进行,box_loss 逐渐下降,表明模型预测的边界框与真实边界框的匹配度越来越高。
train/cls_loss:
(1)这是训练集上的分类损失。分类损失衡量模型对目标类别的预测准确性。
(2)cls_loss 逐渐下降,表明模型在分类方面的性能在逐渐提升。
train/dfl_loss:
(1)这是分布聚焦损失(distribution focal loss),用于帮助模型对目标框的精确定位。
(2)DFL 损失逐渐减小,意味着模型的边界框预测越来越准确。
metrics/precision(B):
(1)这是训练集上的精度(precision)曲线。精度表示模型在检测到的目标中有多少是真正的目标。
(2)精确率的上升表示模型对正样本的识别越来越准确。
metrics/recall(B):
(1)这是训练集上的召回率(recall)曲线。召回率表示模型检测出的真实目标的比例。
(2)召回率逐渐上升,表明模型能够识别出更多的正样本。
val/box_loss:
(1)这是验证集上的边界框损失曲线。
(2)与训练集相似,验证集上的 box_loss 也在逐渐下降,说明模型在未见过的数据上也有较好的边界框预测能力。
val/cls_loss:
(1)这是验证集上的分类损失曲线。
(2)cls_loss 在验证集上同样逐渐下降,表明模型在验证集上的分类性能也在提升。
val/dfl_loss:
(1)这是验证集上的分布聚焦损失曲线。
(2)验证集上的 DFL 损失逐渐减小,意味着模型在未见过的数据上的边界框预测也越来越精确。
metrics/mAP50(B):
(1)这是验证集上的mAP50曲线,表示在交并比阈值为0.5时模型的平均精度(mean Average Precision)。
(2)mAP@50 上升,表明模型的检测性能逐渐提升。
metrics/mAP50-95(B):
(1)这是验证集上的mAP50-95曲线,表示在不同交并比阈值(从0.5到0.95)下模型的平均精度。
(2)随着 mAP@50-95 的上升,表明模型在不同阈值下都具有较好的检测能力。
这些曲线显示模型在训练和验证过程中损失不断下降,精确率、召回率和 mAP 指标逐渐上升,表明模型的性能在逐渐优化并且在验证集上表现良好。
这张图展示的是 Precision-Recall 曲线,用于评估模型在不同类别下的检测性能。以下是详细解释:
三条曲线:
(1)蓝色曲线 (benign 0.889):表示良性结节(benign)的精确率-召回率曲线。精确率和召回率之间的权衡显示模型对良性结节的检测性能。图中右上角靠近1的区域表示该模型在良性结节的检测中精度较高。
(2)橙色曲线 (malignant 0.858):表示恶性结节(malignant)的精确率-召回率曲线。尽管模型对恶性结节的检测略低于良性结节,但也显示出较好的检测效果。
(3)粗蓝色曲线 (all classes 0.874 mAP@0.5):表示所有类别的综合性能。mAP@0.5 是一个常用的目标检测指标,表示在不同阈值下,模型的平均精度。0.874 表示模型在 IOU 阈值为 0.5 时的平均精度为 87.4%。
该图表明,模型在不同的阈值下,能够保持较高的精确率和召回率,特别是在良性结节检测方面性能较好(精确率为 88.9%),在恶性结节的检测上也表现不错(精确率为 85.8%)。
综合mAP为 0.874,表明该模型在甲状腺结节检测任务中的整体表现优秀。表现尤为出色。
模型在所有类别中的表现都很稳定,mAP@0.5为0.986,这表明它能够以较高的置信度准确检测阿尔茨海默病的不同阶段。
4.检测结果识别
模型训练完成后,我们可以得到一个最佳的训练结果模型best.pt文件,在runs/train/weights目录下。我们可以使用该文件进行后续的推理检测。
imgTest.py 图片检测代码如下:
加载所需库:
(1)from ultralytics import YOLO:导入YOLO模型类,用于进行目标检测。
(2)import cv2:导入OpenCV库,用于图像处理和显示。
加载模型路径和图片路径:
(1)path = ‘models/best.pt’:指定预训练模型的路径,这个模型将用于目标检测任务。
(2)img_path = “TestFiles/imagetest”:指定需要进行检测的图片文件的路径。
加载预训练模型:
(1)model = YOLO(path, task=’detect’):使用指定路径加载YOLO模型,并指定检测任务为目标检测 (detect)。
(2)通过 conf 参数设置目标检测的置信度阈值,通过 iou 参数设置非极大值抑制(NMS)的交并比(IoU)阈值。
检测图片:
(1)results = model(img_path):对指定的图片执行目标检测,results 包含检测结果。
显示检测结果:
(1)res = results[0].plot():将检测到的结果绘制在图片上。
(2)cv2.imshow(“YOLOv8 Detection”, res):使用OpenCV显示检测后的图片,窗口标题为“YOLOv8 Detection”。
(3)cv2.waitKey(0):等待用户按键关闭显示窗口
此代码的功能是加载一个预训练的YOLOv8模型,对指定的图片进行目标检测,并将检测结果显示出来。
执行imgTest.py代码后,会将执行的结果直接标注在图片上,结果如下:
这段输出是基于YOLOv8模型对图片“imagetest.jpg”进行检测的结果,具体内容如下:
图像信息:
(1)处理的图像路径为:TestFiles/imagetest.jpg。
(2)图像尺寸为 640×640 像素。
检测结果:
(1)模型在该图片上检测到 2 个良性结节(”2 benign”)
处理速度:
(1)预处理时间:3.2 毫秒
(2)推理时间:4.1 毫秒
(3)后处理时间:45.7 毫秒
模型在处理图片时非常高效,成功检测出2个良性结节,并将结果保存到了指定目录。
运行效果
– 运行 MainProgram.py
1.主要功能:
(1)可用于实时检测目标图片中的甲状腺结节病症;
(2)支持图片、视频及摄像头进行检测,同时支持图片的批量检测;
(3)界面可实时显示目标位置、目标总数、置信度、用时等信息;
(4)支持图片或者视频的检测结果保存。
2.检测结果说明:
这张图表显示了基于YOLOv8模型的目标检测系统的检测结果界面。以下是各个字段的含义解释:
用时(Time taken):
(1)这表示模型完成检测所用的时间为0.203秒。
(2)这显示了模型的实时性,检测速度非常快。
目标数目(Number of objects detected):
(1)检测到的目标数目为1,表示这是当前检测到的第1个目标。
目标选择(下拉菜单):全部:
(1)这里有一个下拉菜单,用户可以选择要查看的目标类型。
(2)在当前情况下,选择的是“全部”,意味着显示所有检测到的目标信息。
类型(Type):
(1)当前选中的行为类型为 “良性结节”,表示系统正在高亮显示检测到的“benign”。
置信度(Confidence):
(1)这表示模型对检测到的目标属于“良性结节”类别的置信度为95.55%。
(2)置信度反映了模型的信心,置信度越高,模型对这个检测结果越有信心。
目标位置(Object location):
(1)xmin: 97, ymin: 84:目标的左上角的坐标(xmin, ymin),表示目标区域在图像中的位置。
(2)xmax: 354, ymax: 338:目标的右下角的坐标(xmax, ymax),表示目标区域的边界。
这些坐标表示在图像中的目标区域范围,框定了检测到的“良性结节”的位置。
这张图展示了甲状腺结节病症的一次检测结果,包括检测时间、检测到的种类、各行为的置信度、目标的位置信息等。用户可以通过界面查看并分析检测结果,提升甲状腺结节病症诊断的效率。
3.图片检测说明
(1)甲状腺恶性结节
(1)甲状腺性结节
点击打开图片按钮,选择需要检测的图片,或者点击打开文件夹按钮,选择需要批量检测图片所在的文件夹。
操作演示如下:
(1)点击目标下拉框后,可以选定指定目标的结果信息进行显示。
(2)点击保存按钮,会对检测结果进行保存,存储路径为:save_data目录下。
检测结果:系统识别出图片中的甲状腺结节病症,并显示检测结果,包括总目标数、用时、目标类型、置信度、以及目标的位置坐标信息。
4.视频检测说明
点击视频按钮,打开选择需要检测的视频,就会自动显示检测结果,再次点击可以关闭视频。
点击保存按钮,会对视频检测结果进行保存,存储路径为:save_data目录下。
检测结果:系统对视频进行实时分析,检测到甲状腺结节病症并显示检测结果。表格显示了视频中多个检测结果的置信度和位置信息。
这个界面展示了系统对视频帧中的多目标检测能力,能够准确识别甲状腺结节病症,并提供详细的检测结果和置信度评分。
5.摄像头检测说明
点击打开摄像头按钮,可以打开摄像头,可以实时进行检测,再次点击,可关闭摄像头。
检测结果:系统连接摄像头进行实时分析,检测到甲状腺结节病症并显示检测结果。实时显示摄像头画面,并将检测到的行为位置标注在图像上,表格下方记录了每一帧中检测结果的详细信息。
6.保存图片与视频检测说明
点击保存按钮后,会将当前选择的图片(含批量图片)或者视频的检测结果进行保存。
检测的图片与视频结果会存储在save_data目录下。
保存的检测结果文件如下:
图片文件保存的csv文件内容如下,包括图片路径、目标在图片中的编号、目标类别、置信度、目标坐标位置。
注:其中坐标位置是代表检测框的左上角与右下角两个点的x、y坐标。
(1)图片保存
(2)视频保存
– 运行 train.py
1.训练参数设置
(1)data=data_yaml_path: 使用data.yaml中定义的数据集。
(2)epochs=150: 训练的轮数设置为150轮。
(3)batch=4: 每个批次的图像数量为4(批次大小)。
(4)name=’train_v8′: 训练结果将保存到以train_v8为名字的目录中。
(5)optimizer=’SGD’: 使用随机梯度下降法(SGD)作为优化器。
虽然在大多数深度学习任务中,GPU通常会提供更快的训练速度。
但在某些情况下,可能由于硬件限制或其他原因,用户需要在CPU上进行训练。
温馨提示:在CPU上训练深度学习模型通常会比在GPU上慢得多,尤其是像YOLOv8这样的计算密集型模型。除非特定需要,通常建议在GPU上进行训练以节省时间。
2.训练日志结果
这张图展示了使用YOLOv8进行模型训练的详细过程和结果。
训练总时长:
(1)模型在训练了150轮后,总共耗时1.105小时。
类别分类:
(1)benign(良性结节):边界框平均精度 (mAP@0.5) 为 0.889,综合平均精度 (mAP50-95) 为 0.674,表示模型在良性结节检测上表现非常好。
(2)malignant(恶性结节):边界框平均精度为 0.858,mAP50-95 为 0.501,恶性结节的检测精度略低于良性结节,但仍有较好的表现。
速度:
(1)预处理速度为0.2ms;
(2)推理速度为2.1ms;
(3)后处理速度为0.8ms;
(4)整体检测速度较快。
结果保存:
(1)Results saved to runs\detect\train_v8:验证结果保存在 runs\detect\train_v8 目录下。
完成信息:
(1)Process finished with exit code 0:表示整个验证过程顺利完成,没有报错。
这个训练日志详细描述了YOLOv8模型在检测甲状腺结节(包括良性和恶性)任务中的表现。经过150个epoch的训练,模型的损失值逐渐减小,平均精度(mAP)在多个IoU阈值下都表现良好,尤其是在良性结节的检测上表现较佳,且验证过程中处理速度也很快。这表明该模型已经过训练优化,可以准确识别甲状腺结节,并能在实际应用中提供快速响应。