教程|使用Conda安装AlphaFold3-个人记录以及遇到的问题
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经过两天修改使用终于完成af3的安装以及样例测试。
!在clone之前可以看一下自己的编译版本比如:gxx_linux-64和gcc_linux-64 如果不行就利用conda更新
conda install gxx_linux-64 gxx_impl_linux-64 gcc_linux-64 gcc_impl_linux-64=13.2.0 -c conda-forge
可以参考链接: AlphaFold3 conda环境下部署
第一步:创建af3环境
先创建af的env环境,然后可以利用上述语句进行更新编译版本
#create conda env
conda create -n af python=3.11
conda activate af3
第二步:从git中clone alphafold3.git以及pip install相关
git clone https://github.com/google-deepmind/alphafold3.git
cd alphafold3
conda install -c bioconda hmmer
pip install -r dev-requirements.txt
pip install . --no-deps -