DeepSeek写的lammps反应势断键动态显示程序
最近DeepSeek比较火，跟风试用了一下。
让DeepSeek写了一个lammps反应势模拟的断键动态显示代码。
假如你是一名lammps专家，现在用reaxff反应势模拟一个聚乙烯裂解的分子动力学模拟，模拟的轨迹文件为：dump.lammpstrj，反应产物信息文件为：bonds.reaxff，bonds.reaxff文件包含了模拟过程中原子之间的键链接信息，请编写一个python程序，实现的功能：从dump.lammpstrj
提取每一帧的原子坐标，从bonds.reaxff文件中提取原子之间的键链接信息，然后把每一帧中原子的键接信息保存到data文件。
DeepSeek思考过程：
好的，我现在需要帮用户解决一个问题，用户希望编写一个Python程序，从LAMMPS的轨迹文件dump.lammpstrj和键信息文件bonds.reaxff中提取数据，生成每帧的data文件。首先，我得理解这两个文件的格式以及如何将它们结合起来。
首先，dump.lammpstrj是LAMMPS的标准轨迹文件，每一帧包含原子的ID、坐标等信息。而bonds.reaxff可能记录了每个时间步的键信息，格式可能包括原子对。我需要确认bonds.reaxff的具体结构，比如是