使用Aspera高速上传文件到ncbi

同事反馈ftp上传ncbi非常慢，远程测试下2个进程上行共在600KB-1MB/S，设置多个线程情况下上行稳定在30Mbps/s左右。

 有更快的上传方式就是使用Aspera工具，于是注册了个帐号，建个sra上传任务，测试了下发现需要下载ssh key。一时找不到在哪下载，给sra@ncbi.nlm.nih.gov发了份邮件咨询怎么下载。下面是回复内容。

The ssh key is now available for download from submission portal. Click the "key file" link on this page:
https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/#files_upload_aspera_cmd
 
There are more upload instructions here: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/submitfiles .

The SRA Team
National Center for Biotechnology Information | National Library of Medicine
National Institutes of Health, Bethesda, Maryland 20892

打开链接https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/#files_upload_aspera_cmd

展开“Upload via Aspera command line or FTP”

 看到这个keyfile点击下载，还有下页会自动生成一个专用目录

下面是我测试上传的命令

"C:\Program Files (x86)\Aspera\Aspera Connect\bin\ascp.exe" -i "d:\aspera.openssh" -QT -l400m -k1 -d "d:\bioproject.xml" subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/邮箱前缀_邮箱域名_生成的随机码

3163MB的文件9分钟多上传完。 

跟ftp对比起来，Aspera相当于高铁，ftp就是绿皮火车，而且还是免费的。