V100 配置 Scanpy + Scvi + Pytorch
V100配置 Scanpy + Scvi + Pytorch
- 创建虚拟环境
- 安装基础包
- 安装 Scanpy
- 安装 Scvi
- 安装 GPU 版本 Pytorch
创建虚拟环境
conda create -n name python=3.8
conda activate name
安装基础包
conda install numpy
安装 Scanpy
conda install scanpy
安装 Scvi
conda install scvi-tools==0.20.1
该命令自动安装的是cpu版本的Pytoch 2.0.0，因此需要手动安装gpu版本Pytorch
安装 GPU 版本 Pytorch
conda install pytorch==2.0.0 torchvision==0.15.0 torchaudio==2.0.0 pytorch-cuda=11.7 -c pytorch -c nvidia