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PBDB Data Service：Ecological and taphonomic vocabulary（生态学和埋葬学术语）

article 2024/9/19 23:54:05

Ecological and taphonomic vocabulary（生态学和埋葬学术语）

- - 描述
  - 参数
  - 术语
  - - 生态位
    - 埋葬学
    - 基础信息

描述

此文描述PBDB中与生态学和埋葬学相关的术语和接口。

参数

类群或化石产出记录的生态学和埋葬学信息会以下面的输出区块返回，您可以使用通用参数show来选择不同的输出区块。在返回化石产出记录和类群记录时均有效。

ecospace：返回一组用于描述生物的生态空间信息的字段。
ttaph：返回一组用于描述生物的埋葬学信息的字段。
etbasis：返回一组字段，描述为其指定该生物的生态空间和埋藏学信息的基本分类。这个信息自动地沿着分类树传播，所以亚类群从它们的父类继承信息。

术语

本节包括一个字段列表和每个字段使用的词汇表。在有多个值时，它们将用逗号分隔。

生态位

字段名称（pbdb）	字段名称（com）	区块名称	描述	值
taxon_environment	jev	ecospace	发现生物时的环境	lagoonal，coastal，inner shelf，outer shelf，oceanic，oligotrophic，mesotrophic，eutrophic，hypersaline，marine，brackish，freshwater，terrestrial
motility	jmo	ecospace	生物是否有运动、附着和/或附生，以及它的运动方式(如果有的话)。这个字段组合了来自数据库locomotion, attached, epibiont列的值。	stationary，facultatively mobile，passively mobile，actively mobile，fast-moving，slow-moving，attached，epibiont
life_habit	jlh	ecospace	这种生物的一般生活方式和位置。该字段组合了来自数据库列life_habit、grouping、clonal、polymorph、depth_habitat的值。	boring，infaunal，shallow infaunal，semi-infaunal，epifaunal，low-level epifaunal，intermediate-level epifaunal，upper-level epifaunal，nektobenthic，nektonic，planktonic，fossorial，semifossorial，ground dwelling，cursorial，saltatorial，scansorial，arboreal，gliding，volant，amphibious，herbaceous，arborescent，aquatic，colonial，gregarious，solitary，clonal，polymorphy，depth=surface，depth=thermocline，depth=subthermocline，depth=deep
vision	jvs	ecospace	这种生物的视觉能力。	blind，limited，well-developed
diet	jdt	ecospace	这种生物的一般饮食或摄食方式。该字段组合了数据库列diet1和diet2的值。	chemoautotroph，photoautotroph，C3 autotroph，C4 autotroph，CAM autotroph，chemosymbiotic，photosymbiotic，herbivore，frugivore，folivore，browser，grazer，granivore，omnivore，insectivore，carnivore，microcarnivore，piscivore，durophage，parasite，suspension feeder，osmotroph，deposit feeder，detritivore，saprophage，coprophage
reproduction	jre	ecospace	这种生物的繁殖方式该字段组合了数据库列reproduction, assexual, broding, dispersal1, dispersal2的值。	oviparous，ovoviviparous，viviparous，alternating，homosporous，heterosporous，seeds，fruits，asexual，brooding，direct/internal，water，wind，animal
ontogeny	jon	ecospace	简要描述这种生物的个体发生。	accretion，molting，addition of parts，modification of parts，replacement of parts

埋葬学

字段名称（pbdb）	字段名称（com）	区块名称	描述	值
composition	jco	ttaph	这种生物骨骼部分的组成。这个字段组合了数据库列compostion1, compostion2的值。	aragonite，calcite，high Mg calcite，intermediate Mg calcite，low Mg calcite，hydroxyapatite，phosphatic，calcified cartilage，silica，agglutinated，chitin，lignin，sclero-protein，cutan/cutin，other，no hard parts
architecture	jsa	ttaph	内部骨骼结构。	porous，compact or dense
thickness	jth	ttaph	骨骼的相对厚度。	thin，intermediate，thick
reinforcement	jsr	ttaph	骨骼加固，如果有的话。该字段组合了数据库字段的值fold, ribbing, spine, internal_reinforcement。	none，minor folds，major folds，minor ribbing，major robbing，minor spines，major spines，minor internal reinforcement， major internal reinforcement

基础信息

本节中列出的字段列出了与生态空间和采掘组信息各部分相关的分类。它可能是直接查询的分类群，也可能是它的一个超分类群。一般来说，除非特定的亚类群被覆盖，否则这些信息会沿着分类层次向下传递。

字段名称（pbdb）	字段名称（com）	区块名称	描述
environment_basis	jec	ecospace	显示taxon_environment的基本分类。
motility_basis	jmc	etbasis	显示motilityt的基本分类。
llife_habit_basis	jhc	etbasis	显示life_habit的基本分类。
vision_basis	jvc	etbasis	显示显示vision_basis的基本分类。
diet_basis	jdc	etbasis	显示diet的基本分类。
reproduction_basis	jrc	etbasis	显示reproduction的基本分类。
ontogeny_basis	joc	etbasis	显示ontogeny的基本分类。
taphonomy_basis	jtc	etbasis	显示composition，architecture，thickness，reinforcement的基本分类。如果它们来自不同的基分类，则报告最低的一个(最接近被查询的分类)。