科研绘图系列:R语言单细胞差异基因四分图(Quad plot)
介绍
在单细胞分析领域,为了探究不同分组间同一细胞类型的基因表达差异,研究者们常采用四分图(Quad Plot)作为分析工具。该图形的横轴代表比较组1,而纵轴代表比较组2。通过这种布局,四分图能够有效地展示两组间共有的差异表达基因,从而为深入理解细胞类型在不同条件下的分子特性提供直观的视角。这种可视化方法不仅揭示了组间基因表达的异同,还有助于识别可能在生物学过程或疾病发生中起关键作用的基因。
加载R包
导入所需要的R包,在导入前需要用户自己安装。
library(tidyverse)
library(Seurat)
library(ggrepel)
# rm(list = ls())
options(stringsAsFactors = F)
options(future.globals.maxSize = 1000 * 1024^2)
导入数据
单细胞Seurat数据可从以下链接下载(画图所需要的所有数据):
-
百度云盘链接