【3D Slicer】的小白入门使用指南十
3D Slicer肿瘤、囊性等多组织同步半自动分割勾画
任务
探讨肿瘤周围白质纤维在脑肿瘤切除神经外科计划中的应用
35岁,患有多发性胶质母细胞瘤
胶质母细胞瘤
- 胶质母细胞瘤(GBM)是一种快速生长的高级别原发性胶质瘤。
- 当前的治疗选择结合了手术、放疗和化疗。
- GBM扩散到与运动功能、语言或视觉相关的关键区域。
GBM手术
- 脑肿瘤手术的目标是在保留关键白质纤维的同时,尽可能地切除肿瘤。
- 由于肿瘤的浸润性,实现GBM手术中的完全切除是一个挑战。
图片由布里格姆和妇女医院的Alexandra Golby博士提供
脑外科手术中的扩散MRI
- 扩散MRI能够无创地探索白质解剖
- 纤维束成像技术可以在脑肿瘤切除手术规划中提供临床相关的信息。
总体目标
本教程提供了一个端到端的解决方案,用于分割肿瘤轮廓并在病变附近生成白质纤维束。
步骤
工作流程概览
- 步骤1:肿瘤分割
- 步骤2:纤维束生成
- 步骤3:交互式探索
图像处理工作流程
本教程描述的图像处理工作流程使用了三种算法:
● 用于肿瘤分割的生长切割算法Grow Cut
● 用于表面建模的Marching Cube算法
● 用于纤维束生成的单张量流线纤维束成像算法Single tensor streamline tractography
总体目标
本教程提供了一个端到端的解决方案,用于分割肿瘤轮廓并在病变附近生成白质纤维束。
1、数据加载部分
教程材料
- 3D Slicer,已经有了
- SlicerDMRI扩展,也有了
- 白质探索数据集
教程数据包括一个基线体积和一个扩散张量成像&#