Rosetta从头蛋白抗体设计、结构优化及在药物研发中的应用
Rosetta从头蛋白抗体设计、结构优化及在药物研发中的应用
| 第一天 | ||
| 内容 | 主要知识点 | |
教学目标：了解本方向内容、理论基础、研究意义。 |
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三. 蛋白质结构viewer 、Linux和Python基础 教学目标：能够使用vim编辑器简单编辑文件，能够使用PyMOL或ChimeraX查看蛋白质结构。 |
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五．序列设计 PackRotamer和FastDesign 教学目标：了解Rosetta封装好的应用（以relax为例）和RosettaScript编写应用（以pack/min/pack为例）。 |
5.1 Movemap
6.1 Filter ResidueSelector TaskOperation 6.2 DSSP/Disulfidize Mover | |
| 第二天 | ||
| 内容 | 主要知识点 | |
| 六. 蛋白-蛋白对接基础 教学目标：了解基于序列和基于结构的蛋白质复合物预测手段。 |
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| 七. 抗体设计 教学目标：熟悉抗体模型预处理流程, 掌握RAbD常用命令 |
案例实践：
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| 八. CartisenDDG 突变扫描 九. RosettaScript应用 教学目标：熟悉RosettaScript开发流程，了解序列与结构设计原理，完成从头蛋白质设计的操作练习。 |
案例实践：
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