聚类算法k-means(手撕和调用skl)
定义
K均值聚类(k-means clustering)算法是一种常用的、基于原型的聚类算法,简单、直观、高效。其步骤为:
第一步:根据事先已知的聚类数,随机选择若干样本作为聚类中心,计算每个样本与每个聚类中心的欧式距离,离哪个聚类中心近,就算哪个聚类中心的聚类,完成一次聚类划分.
第二步:计算每个聚类的几何中心,如果几何中心与聚类中心不重合,再以几何中心作为新的聚类中心,重新划分聚类. 重复以上过程,直到某一次聚类划分后,所得到的各个几何中心与其所依据的聚类中心重合或足够接近为止. 聚类过程如下图所示:
注意事项:
(1)聚类数(K)必须事先已知,来自业务逻辑的需求或性能指标.
(2)最终的聚类结果会因初始中心的选择不同而异,初始中心尽量选择离中心最远的样本.
手撸k-means
原理
上述公式不好求解,一般我们通过迭代的方式近似化求解
代码实现
数据集选择西瓜书中提供的数据
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import math
data = pd.read_csv('西瓜数据集4.0.csv')
feature = ['密度','含糖率']
data = data[feature]
K = 3
#随机选取簇初始化
C_list = data.sample(K).values
data = data.values
while True:
C_cluster = [[] for _ in range(K)]#存放每个簇的数据
for i in range(len(data)):
C_dist = {}#字典形式存放每个元素对于每个簇的距离,以此来判断该放入哪个簇
for j in range(len(C_list)):
diff = math.sqrt((data[i][0]-C_list[j][0])**2+(data[i][1]-C_list[j][1])**2)
C_dist[j] = diff
C_dist_sort = sorted(C_dist.items(),key = lambda x:x[1])
print(C_dist_sort)
C_cluster[C_dist_sort[0][0]].append(data[i])
print(C_cluster)
flag = True#用于判断是否结束循环
#计算每个簇的均值并置为新的中心点,若均值与之前相等则结束循环
for i in range(len(C_list )):
i_mean = np.mean(C_cluster[i],axis = 0)
for j in range(i_mean.shape[0]):
if i_mean[j] != C_list [i][j]:
flag = False
C_list [i] = i_mean
break
if flag:
break
color = np.random.random((3,K)) #随机颜色
#得到最终的分类结果并绘图
for i in range(K):
C = C_cluster[i] #每一簇的元素
x = [i[1] for i in C]
y = [i[0] for i in C]
plt.scatter(x,y,c = color[i],label = 'C'+str(i)) #随机颜色
plt.legend()
plt.xlabel('midu')
plt.ylabel('hantang')
plt.show()
将聚类后结果绘制出来
调用sklearn的库函数
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import sklearn.cluster as sc
data = pd.read_csv('西瓜数据集4.0.csv')
feature = ['密度','含糖率']
data = data[feature]
model = sc.KMeans(n_clusters=4)
model.fit(data)
label = model.labels_
result_y = model.predict([[0.4,0.5]])
print(result_y)
plt.scatter(data['含糖率'],data['密度'],c= label,cmap='spring')
plt.xlabel('midu')
plt.ylabel('hantang')
plt.legend()
plt.show()
特点及使用
优点
(1)原理简单,实现方便,收敛速度快;
(2)聚类效果较优,模型的可解释性较强;
缺点
(1)需要事先知道聚类数量;
(2)聚类初始中心的选择对聚类结果有影响;
(3)采用的是迭代的方法,只能得到局部最优解;
(4)对于噪音和异常点比较敏感.
什么时候选择k-means
(1)事先知道聚类数量
(2)数据分布有明显的中心