R 语言科研绘图第 4 期 --- 折线图-置信区间
在发表科研论文的过程中，科研绘图是必不可少的，一张好看的图形会是文章很大的加分项。
为了便于使用，本系列文章介绍的所有绘图都已收录到了 sciRplot 项目中，获取方式：
R 语言科研绘图模板 --- sciRplot
https://mp.weixin.qq.com/s/QA_8LVqjkdg4A16zLonw4w?payreadticket=HGMfMKFA-V_LSJGoSMvVaLr36XHris83CtP8hYw2AoOIRrKY2JK84QJYzBbep4KF5I1MLdY
本期绘图预览：
1. 导入包
我们首先导入本期绘图用到的 R 包：
library(ggplot2)2. 准备数据
接下来我们导入绘图用到的数据，在 sciRplot 中给大家提供了测试数据：
data <- sciRplot_data
3. 准备配色
颜色的选择往往是一件让人特别纠结的事情，这里我们直接使用 sciRcolor 来设置配色：
colors <- sciRcolor::pal_scircolor(37)[1]sciRcolor 是为了 R 语言科研绘图开发的配色工具，包含了 100 种常用配色，详细信息见：
R 语言科研配色工具 --- sciRcolorhttps://mp.weixin.qq.com/s/XZol4VxvHnJD_49ij3f2mg?payreadticket=HJOtUWgdMrr3zuyYr7LGxqkLvTHj5DPx4C2qJl1zvrGPtAFRjPpnTKBLZKmi4ISZ1rXiNEY
4. 绘制图形
接下来我们通过下面的代码来绘制图形：
p <-ggplot(data, aes(x=Date, y=Value, group=1)) +stat_summary(geom = 'ribbon', fun.data='mean_cl_boot',fun.args = list(conf.int = .95),fill="gray", alpha=0.8) +stat_summary(geom = 'line', fun='mean', cex=2, color=colors) +labs(x="Date", y="Value") +scale_y_continuous(breaks=seq(80,380,50), limits = c(80,380),expand = expansion(mult = c(0, 0.05))) +theme_classic(base_size = 25) +theme(panel.grid.major.y = element_line())p
5. 保存图形
最后我们保存绘制的图形：
ggsave("save/line-confidence.png", p, width = 8, height = 6, dpi = 300)
sciRplot 介绍
为了解决 R 语言中科研绘图的问题，我推出了 sciRplot 项目。sciRcolor 项目包含了以下内容：
① 100 种绘图代码，按照图形类型进行分类，包含 60 种基础绘图和 40 种进阶绘图
② 配备一站式 html文档，包含测试数据，代码一键复制，交互式阅读提高用户体验
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