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在Ubuntu 16.04上安装R的方法

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简介

R 是一种流行的开源编程语言,专门用于统计计算和图形处理。它被广泛用于开发统计软件和进行数据分析。R 很容易扩展,社区以不断添加特定研究领域的用户生成包而闻名,这使得它适用于许多领域。

在本教程中,我们将安装 R,并展示如何从官方 Comprehensive R Archive Network (CRAN) 添加包。

先决条件

要跟着做,你需要一个 Ubuntu 16.04 服务器,具备以下条件:

  • 至少 1GB 的 RAM
  • 一个具有 sudo 权限的非 root 用户。要了解如何设置,请参考我们的初始服务器设置指南。

一旦满足这些先决条件,你就可以开始了。

步骤 1 — 安装 R

R 是一个快速发展的项目,最新的稳定版本并不总是可以从 Ubuntu 的仓库中获取,因此我们将首先添加由 CRAN 维护的外部仓库:

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
gpg: requesting key E084DAB9 from hkp server keyserver.ubuntu.com
gpg: key E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported
gpg: Total number processed: 1
gpg:               imported: 1  (RSA: 1)

一旦我们在每台服务器的数据库中有了可信任的密钥,我们就可以添加仓库。

sudo add-apt-repository 'deb [arch=amd64,i386] https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/'

我们需要在此之后运行 update 命令,以便从新仓库中包含软件包清单:

sudo apt-get update
. . .
Get:6 https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ InRelease [3,590 B]
Get:7 https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages [31.5 kB]
. . .

如果上面的行出现在 update 命令的输出中,那么我们已经成功添加了仓库。我们可以确保不会意外安装旧版本。

现在我们准备安装 R:

sudo apt-get install r-base

在撰写本文时,CRAN 的最新稳定版本是 3.3.1,在启动 R 时会显示。由于我们计划为系统上的所有用户安装示例包,因此我们将以 root 用户身份启动 R,以便库将自动对所有用户可用:

sudo -i R
R version 3.3.1 (2016-06-21) -- "Bug in Your Hair"
. . .
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
>

这证实我们已成功安装了 R 并进入了其交互式 shell。

步骤 2 — 从 CRAN 安装 R 包

R 的强大之处之一在于其丰富的附加包。为了演示目的,我们将安装 txtplot,一个可以输出 ASCII 图形(包括散点图、折线图、密度图、自相关函数图和条形图)的库:

install.packages('txtplot')

在安装过程中,你将被要求选择要安装的镜像:

--- 请选择此会话中要使用的 CRAN 镜像 ---
HTTPS CRAN 镜像

1: 0-Cloud [https]                 2: Algeria [https]
3: Australia (Melbourne) [https]   4: Australia (Perth) [https]
5: Austria [https]                 6: Belgium (Ghent) [https]
7: Brazil (SP 1) [https]           8: Bulgaria [https]
9: Canada (MB) [https]            10: Chile [https]
11: China (Beijing 4) [https]      12: Colombia (Cali) [https]
13: Czech Republic [https]         14: Denmark [https]
15: France (Lyon 1) [https]        16: France (Lyon 2) [https]
17: France (Marseille) [https]     18: France (Paris 2) [https]
19: Germany (Falkenstein) [https]  20: Germany (Münster) [https]
21: Iceland [https]                22: Ireland [https]
23: Italy (Padua) [https]          24: Japan (Tokyo) [https]
25: Malaysia [https]               26: Mexico (Mexico City) [https]
27: New Zealand [https]            28: Norway [https]
29: Philippines [https]            30: Russia (Moscow) [https]
31: Serbia [https]                 32: Spain (A Coruña) [https]
33: Spain (Madrid) [https]         34: Switzerland [https]
35: Taiwan (Chungli) [https]       36: Turkey (Denizli) [https]
37: UK (Bristol) [https]           38: UK (Cambridge) [https]
39: UK (London 1) [https]          40: USA (CA 1) [https]
41: USA (IA) [https]               42: USA (KS) [https]
43: USA (MI 1) [https]             44: USA (TN) [https]
45: USA (TX) [https]               46: USA (WA) [https]
47: (HTTP mirrors)

Selection: 1

我们输入 1 选择 0-Cloud,这将连接我们到由 RStudio 提供的内容交付网络(CDN),以获取地理位置最近的选项。此镜像将被设置为会话的默认值。一旦退出 R 并重新进入,你将被提示再次选择镜像。

安装完成后,我们可以加载 txtplot

library('txtplot')

如果没有错误消息,那么库已成功加载。现在让我们通过一个示例来看看它的效果,该示例演示了一个带有轴标签的基本绘图函数。该示例数据由 R 的 datasets 包提供,包含了 1920 年代的汽车速度和制动距离:

txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = "speed", ylab = "distance")
      +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
  120 +                                                   *    +
      |                                                        |
d 100 +                                                   *    +
i     |                                    *                *  |
s  80 +                          *         *                   +
t     |                                       * *    *    *    |
a  60 +                          *  *      *    *      *       +
n     |                        *         * *  * *              |
c  40 +                *       * *    *  *    * *              +
e     |         *      *  * *  * *  *                          |
   20 +           *    *  * *       *                          +
      |  *      *    *                                         |
    0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
           5          10           15          20          25
                                speed

如果你对 txtplot 感兴趣,可以使用 help(txtplot) 来了解更多。

可以使用 install.packages() 从 CRAN 安装任何预编译的包。要了解更多可用内容,你可以在任何镜像上的“Packages”链接下找到按名称或发布日期组织的官方包列表。

结论

现在您已成功安装了 R,您可能对安装开源的 RStudio 服务器感兴趣。RStudio 服务器是一个运行在远程 Linux 服务器上的 R 版本的界面,它为您刚刚完成的基于服务器的部署带来了一个集成开发环境(IDE)。您可能还对如何直接从 GitHub、BitBucket 或其他位置安装感兴趣,以便充分利用活跃社区的最新工作。


http://www.kler.cn/a/307555.html

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